桶裝水開封后細菌超標，這個命題本身就不準確。到底是桶裝水本身打開蓋后細菌超標，還是通過飲水機流出的水細菌超標，這分別指的是兩個概念。一般來說，桶裝水本身細菌不會超標，因為我國對此有嚴格的控制，也有相關的標準來制約。從桶裝水的出廠日期算起，合格的礦泉水開封三天細菌很難超標。目前，通常情況下，桶裝水都是跟飲水機搭配使用的，而因飲水機本身二次污染造成的桶裝水細菌超標則較多。特別是飲水機出水口長期暴露容易引起細菌超標。
實際上，準確的說法，應該是桶裝水開封后容易引起微生物污染。而微生物污染程度，取決于水的品種和來源地，周邊環境的污染程度，以及存放的時間長短。水源地不同，水質不同，那么細菌含量也會稍有差別。目前，與礦泉水相比，純凈水的污染程度更大。礦泉水是指從地下深處自然涌出的或經鉆井采集的水，含有一定量的礦物質，如鈣、鎂、鉀、鈉、偏硅酸、鋅、硒等。國家對一些微量元素的含量是有要求的，例如鋅必須大于等于0.2毫克/升，硒必須大于等于0.01毫克/升。而純凈水是以直接來源于地表、地下或公共供水系統的水為水源，經適當的水凈化加工方法制得的水。相比于純凈水，礦泉水的抑菌能力較強，抗污染能力強一些。因此建議優選礦泉水，且開封后盡快喝完。
水與人的生存密切相關，由于水的包溶性強、溶解性強、滲透力強等特性，而且水無孔不入，“看不見”的各種污染物質無時無刻無處都在通過水威脅我們的健康，水的安全性顯得比一般食品安全更為突出。目前我國對于水能不能喝的標準，現在很多國家已不再采用菌落總數作為標準了，而是注重水中致病細菌的情況。而包裝飲用水國標之所以新增銅綠假單胞菌作為檢查項目，是考慮到了銅綠假單胞菌具有致病性。銅綠假單胞菌不合格項目可能引起食用者腹瀉、急性腸道炎、皮膚炎癥等病癥。國標中還明確指出，每250mL水樣中銅綠假單胞菌不得檢出，并且要求出廠前對每批次成品進行銅綠假單胞菌檢測。如果檢出，則為不合格產品，應該召回和停止銷售。
